目的は、主に現在注目されているメタボリックシンドロームの低減と糖尿病の低減にある。したがって健診のメニューは
・疾病の既往歴の調査
・身体測定（身長、体重、腹囲）
・血圧測定
・血液検査（脂質ー中性脂肪、HDL、LDLｺﾚｽﾃﾛｰﾙ　
　　　　　血糖値
　　　　　肝機能ーGOT、GPT、γーGTP）
・検尿
となっている。

厚生労働省としては毎年増大する医療費削減が主目的と思われる。
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が、そのために医師会等からは本来の重大な疾病早期発見するという目的がないがしろにされ、あまりに生活習慣病の予防にシフトしすぎる、という批判も一方ではある。

が、先進諸国のどの国においても高齢化社会への移行とそれに伴う医療費の増大そして保険制度の維持への課題は深刻度を増している。
どの国においても、また日本に置ける医療制度改革についても、医療そのものへの対応が主で予防という観点での取り組みが遅れていたように思う。

健診制度が義務付けられたからといって劇的に生活習慣病が改善され医療費も削減されると過剰に期待することはできない（具体的な健康へのアクションにつながらないと、単に健診だけでは医療費は削減されないだろう）。

年々高まる健康ブームに便乗し、この健診制度を契機にもっと予防への取り組みの啓蒙に力を入れるべきだと思う。

地方の町では、病院が老人達の憩いの場となっていたのが、町長の指導で温浴施設を造り、また毎朝のストレッチ体操を広めて劇的に医療費の削減に成功したという事例も聞く。